北京中医药大学校标图案由蛇、手杖、杨柳枝和心形外框组成。
标志中央“蛇与手杖”图案是国际通行的医药卫生标志。蛇象征智慧。手杖变形为针形，象征东西方医学的交流与融合。杨柳枝象征生命和吉祥，也是天然药用植物的代表，并寓意中医药人才的茁壮成长。蛇与手杖、交叉的杨柳枝分别组合成英文字母“B”和“U”的形状，是校名中“Beijing”和“University”的缩写，突显我校的地域特征和高等医学教育的特色。心形外框顶部镂中英文校名。图案选用学校标准红色-宫墙红，如同顽强的生命之火，映照出中医药学源远流长、博大精神的历史脉络。
标志的整体寓意为：北京中医药大学以德行和智慧培育英才，以仁爱之心包容四海，以中国医药造福人类。
“勤求博采”：语出医圣张仲景《伤寒杂病论·原序》：“勤求古训，博采众方。”现用以表示我校师生要做到勤奋研求，广博采搜，汇通中西，学贯古今。此4字集中讲治学态度和治学方法。
“厚德济生”：厚德，语出《易·坤卦》：“地势坤，君子以厚德载物。”厚德济生四字合而表示师生要宽厚仁爱，品德高尚，以仁术普济苍生，全面服务社会。此4字主要讲品德修养、做人、做事。
以上八字还寓含继承与发展相结合、中医与西医相结合、传统与现代相结合的理念。
校旗设计为白底红字，中央印有启功题写的“北京中医药大学”字样，上方配以宫墙红色校徽。
寓意：北京中医药大学传承圣洁医道、播撒济世丹心。
从容自信的办学定力
宁静致远的育人态度
海纳百川的包容胸怀
独立涛头的举旗意识
校风：自信向善，和而不同
出处：
1.《墨子·亲士》:“君子进不败其志,内究其情；虽杂庸民,终无怨心,彼有自信者也。”
2.《礼记·大学》：“大学之道，在明明德，在亲民，在止于至善。”
3.《论语·子路》：“君子和而不同，小人同而不和。”
释义：
1.“自信”是60多年发展历程中北中医人积淀的独特性格气质，表现为对传承的坚守和敢为人先勇气。正因为自信，北中医以高度文化自觉，为推动中医药振兴发展做出重要贡献，以从容自信的办学定力，向着世界一流大学的宏伟目标迈进。
2.“善”有三层含义。一是仁爱之善，北中医人的仁心仁术，救死扶伤之精神品质为社会广泛认同，也是我们不懈的精神追求；二是至善、首善，“追求卓越，止于至善”是北中医永恒的精神追求，要以“首善”的标准继续严格要求自己；三是善待师生的理念。
3. “和”蕴含三方面意义。一是体现了中医崇尚和谐的价值取向，表现为天人合一的整体观，阴阳平和的健康观，调和致中的治疗观，以及医患信和、同道谦和的道德观；二是北中医兼容并包的办学气度，面对不同的流派及思想，逐渐形成了“百花齐放、百家争鸣”的文化气候；三是北中医团结和谐的办学氛围，始终为了传承发展中医药事业的共同目标努力奋斗。
4.“不同”蕴含两层含义。一是表达北中医兼容并包，尊重个体，尊重思想独立性的胸怀；二是鼓励创新，多年来北中医之所以能始终引领高等中医药教育的发展方向，正是基于在继承的同时，敢于打破常规，敢于创新、追求卓越的勇气。
“自信向善，和而不同”所表现出来的笃定与仁爱、包容与开放共享的情怀，正是历代北中医人品格风范的真实写照，也是未来全体北中医人应该秉承和发扬的良好风尚。
教风：崇德尚学，承古纳新
出处：
1.《礼记·大学》：“大学之道，在明明德，在亲民，在止于至善。”
2.《易·系辞传》:“其至矣乎！夫《易》，圣人所以崇德而广业也。”
3.《师说》：“古之学者必有师。”
4.《礼记·大学》：“苟日新，日日新，又日新。”
释义：
1.“崇德”是中医人立身之根基，德也是教育之首要意义。建校60多年来，北中医涌现出众多德艺双馨的名家与名师，培育了无数高素质的杏林人才。正因崇德，才更显使命高尚，也是全体教师立德树人的真实写照。
2.“尚学”就是要求我们钻研学问、尊重知识、追求真理、探索未知、陶冶情操、传承文明，此乃办学之基本。我校教师严谨治学、尊崇学术，精研岐黄之道，也昭示了我校倡导的“人心向学”理念。
3.“承古”的含义就是不忘中医之本，中医学术代代相传，也倡导“更加经典”。北中医的学者承古圣先贤之道，发皇古义，传授真知。传承要从中医药的学术本源做起，几十年来形成了“重传承”的育人特色。
4.“纳新”，北中医的教师更承担发展中医药学术的历史使命，在传承中发展，在发展中创新，站在科学研究与学科建设的前沿，借助现代科学技术的进步推动中医药事业的发展。用开放的胸怀，纳入新知，启迪广大学人。中华文明一直拥有纳新开新的基因，中医药事业在新时代也是日新月异发展。在变革中坚守中医药的核心使命，积极为多样化、个性化、创新型人才成才提供良好环境和机制。
“崇德尚学，承古纳新”所彰显的师德与学养风范，所坚守的传承与创新品质，正是历代北中医教师品格风范的真实写照，也是当今和未来全体北中医人应该秉承和发扬的良好风尚。
学风：博学勤思，笃诚践行
出处：
1.《礼记•中庸》：“博学之，审问之，慎思之，明辨之，笃行之。”
2.《论语•为政》：“学而不思则罔，思而不学则殆。”
3.《礼记•中庸》：“诚者天之道也，诚之者人之道也。”
4.《朱子语类》：“只有两件事：理会，践行。”
释义：
1.“博学”：医道“至精至微之事”，习医之人必须“博极医源，精勤不倦”，非学无以广才，非才无以济世。“博”还意味着博大和宽容，惟有如此，才能兼容并包，使为学更具有世界眼光和开放胸襟，真正做到“勤求博采”。
2.“勤思”: 指勤于思考、审虑周密、探求真谛、把握规律。只有学思结合、活学活用，才能独辟蹊径、探究真知。
3.“笃诚”：“笃”有忠贞不渝，踏踏实实，一心一意，坚持不懈之意；“诚”指待人接物诚实守信。大医精诚，止于至善。医者要有高尚的品德修养，以“见彼苦恼，若己有之”感同身受，策发“大慈恻隐之心”，进而发愿立誓“普救含灵之苦”。坚定的理想信念和济世仁心是成就“大医”的基础。
4.“践行”：为学的最后阶段。指身体力行，延伸为不断实践创新。做到学有所得，践履所学，知行合一，方能实现理想，服务于人类健康事业。
“博学勤思，笃诚践行”是对北中医建校60多年来学生风貌的集中展示。表达了北中医人以深厚的底蕴，严谨的治学态度，坚定的济世理想和躬身服务的奉献精神，为人类健康事业发展而孜孜以求的治学态度。
